实验室设备的种类用很多，用途也不一样。必须要按照指南来小心使用。
一、植物总DNA提取设备配置

提取植物总DNA的主要设备为：砂浆、液氮罐、电热恒温水浴、小容量离心机、大容量离心机、冰箱、紫外分光光度计等。

二、PCR反应系统设备配置
实验室应能进行PCR反应实验，一般采用以下实验设备：超净操作平台、涡流振荡器、小容量离心机和PCR仪。由于PCR技术的改进，也降低了环境的要求，为方便起见，许多人不在无菌平台上进行PCR反应。但是，超净操作平台仍然是分子实验室必不可少的仪器，许多实验都必须在超净操作平台上进行。
三、凝胶电泳及显色系统设备配置
凝胶电泳系统的主要功能是检测提取的总DNA质量和PCR扩增产物。整个过程需要电泳仪、电泳槽、微波炉、振动筛、胶盆、灯箱、紫外线灯和一些常规的小工具。
四、凝胶成像及数据处理系统设备配置
为了能够观察、记录实验过程、永久保存实验结果和处理和分析大量分子数据，凝胶成像、图像存储和数据处理系统是必需的。在分子植物育种实验中，分子数据的获取和分析是分子育种的核心环节。只有得到的分子和表型数据的数据可以得到充分和彻底的分析，从而在实际育种中可以获得更有效的使用。该系统主要包括凝胶成像系统、扫描仪以及各种生物应用软件。
五、其它的常规设备
分子生物学实验对实验操作环境和反应溶液具有较高的要求。首先，实验用水水质好，纯度高。大部分的实验水都要求是超纯水.因此，有必要配置纯水装置和超纯水装置。第二，无菌环境。离心管、头端、一些配备溶液的容器和许多溶液必须经过灭菌和灭菌。因此，分子实验室也需要高压釜和干燥箱。必须始终在无菌条件下进行大量的实验步骤，因此无菌手术台是不可缺少的。此外，溶液的取样、pH值和纯度应准确。因此，高精度电子天平和pH计是用于分配的必要仪器，磁力加热搅拌器是良好的辅助装置。还有一个吸管，是一种精密的取样仪器。根据取样量的要求，可选择不同取样尺寸的吸管分子。这就需要一个良好的制冷系统，一般的分子实验室有一个温度为4°；C和-20°；C的冰箱，最好的是-70°；C。
六、易耗品
作为一个分子实验室，有相当多的消耗品。这里我们主要指一些消费量大的产品。首先是手套。在该实验室中，无论手套是否有毒，无论何时戴上手套，原则上，无论是否接触，手套的使用都是相当可观的。第二，针头和针头盒。针尖与吸管一起用于移动溶液、样品等。还有离心管和离心管支架，实验室必须与离心机和PCR仪配套，离心管支架也必须与离心管配套。最后，一张玻璃片、一把梳子、一条胶带和一个夹子，视实验室的电泳槽而定，通常会配备一些，但这些数量一般不够，必须单独购买。
实验室设备使用时必须十分小心，务必按照使用指南来操作